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AtGenExpress median gene expression + PLACE promoter motif

Developmental Microarray Expression Data (AtGenExpress) of plant developmental tissues, combined with PLACE (Plant Cis-acting Regulatory DNA Elements) motif database. We took the median of triplicate measurements from AtGenExpress, then sorted the developmental series into plant organs (Flower, Leaf, Root, Stem, Fruit & Seeds), with one category for seedlings (8 days old or less) and another for whole plants (older than 8 days). For each motif, we calculated the position relative to the TSS as determined experimentally. Gene Loci without expression data or motif data were removed from this database.

References (for PLACE)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9847208
References (for AtGenExpress)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15806101


Descriptions for each data table:
AtGenExpress_PLACE_Flowering_median
This collection of Gene Expression Properties are associated with flowering tissues.
AtGenExpress_PLACE_Fruit_Seeds_median
This collection of Gene Expression Properties are associated with fruit and seed tissues.
AtGenExpress_PLACE_Leaf_median
This collection of Gene Expression Properties are associated with leaf tissues.
AtGenExpress_PLACE_Root_median
This collection of Gene Expression Properties are associated with root tissues.
AtGenExpress_PLACE_Seedling_median
This collection of Gene Expression Properties are associated with seedling tissues.
AtGenExpress_PLACE_Stem_median
This collection of Gene Expression Properties are associated with stem tissues.
AtGenExpress_PLACE_Whole_Plant_median
This collection of Gene Expression Properties are associated with whole plant body parts.
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ファイル名
AtGenExpress_PLACE_Flowering_median
テーブルデータ (テキスト)
2013.4.30
9.5MB
テーブルデータ (Excel)
2013.4.30
16.5MB
RDF (Turtle)
2013.4.30
72.3MB
AtGenExpress_PLACE_Fruit_Seeds_median
テーブルデータ (テキスト)
2013.4.30
5.8MB
テーブルデータ (Excel)
2013.4.30
9.5MB
RDF (Turtle)
2013.4.30
30.1MB
AtGenExpress_PLACE_Leaf_median
テーブルデータ (テキスト)
2013.4.30
7.1MB
テーブルデータ (Excel)
2013.4.30
11.9MB
RDF (Turtle)
2013.4.30
44.9MB
AtGenExpress_PLACE_Root_median
テーブルデータ (テキスト)
2013.4.30
5.5MB
テーブルデータ (Excel)
2013.4.30
8.9MB
RDF (Turtle)
2013.4.30
27.2MB
AtGenExpress_PLACE_Seedling_median
テーブルデータ (テキスト)
2013.4.30
6.5MB
テーブルデータ (Excel)
2013.4.30
10.7MB
RDF (Turtle)
2013.4.30
37.8MB
AtGenExpress_PLACE_Stem_median
テーブルデータ (テキスト)
2013.4.30
5.0MB
テーブルデータ (Excel)
2013.4.30
7.9MB
RDF (Turtle)
2013.4.30
21.7MB
AtGenExpress_PLACE_Whole_Plant_median
テーブルデータ (テキスト)
2013.4.30
5.1MB
テーブルデータ (Excel)
2013.4.30
7.8MB
RDF (Turtle)
2013.4.30
21.6MB
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最初に登録した日 Apr 5, 2013
最後に更新した日 May 1, 2013

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