Developmental Coexpression (AtGenExpress + ATTED-II promoter motif) mean

Developmental Microarray Expression Data (AtGenExpress) of plant developmental tissues, combined with CEG coexpression analysis regulatory (7mer) motif calculations (ATTED-II). We took the mean of triplicate measurements from AtGenExpress, then sorted the developmental series into plant organs (Flower, Leaf, Root, Stem, Fruit & Seeds), with one category for seedlings (8 days old or less) and another for whole plants (older than 8 days). Gene Loci without expression data or motif data were removed from this database.

References (for ATTED-II):
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17130150
References (for AtGenExpress)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15806101

Descriptions for each data table:

AtGenExpress_ATTED_Flowering_mean	This collection of Gene Expression Properties are associated with flowering tissues.
AtGenExpress_ATTED_Fruit_Seeds_mean	This collection of Gene Expression Properties are associated with fruit and seed tissues.
AtGenExpress_ATTED_Leaf_mean	This collection of Gene Expression Properties are associated with leaf tissues.
AtGenExpress_ATTED_Root_mean	This collection of Gene Expression Properties are associated with root tissues.
AtGenExpress_ATTED_Seedling_mean	This collection of Gene Expression Properties are associated with seedling tissues.
AtGenExpress_ATTED_Stem_mean	This collection of Gene Expression Properties are associated with stem tissues.
AtGenExpress_ATTED_Whole_Plant_mean	This collection of Gene Expression Properties are associated with whole plant body parts.

評価指数

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ファイル名
AtGenExpress_ATTED_Flowering_mean			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.22	4.5MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.22	8.1MB
RDF (Turtle)	2013.4.22	35.3MB
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AtGenExpress_ATTED_Fruit_Seeds_mean			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.22	2.7MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.22	4.5MB
RDF (Turtle)	2013.4.22	13.8MB
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AtGenExpress_ATTED_Leaf_mean			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.22	3.3MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.22	5.7MB
RDF (Turtle)	2013.4.22	21.3MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_ATTED_Root_mean			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.22	2.5MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.22	4.1MB
RDF (Turtle)	2013.4.22	12.3MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_ATTED_Seedling_mean			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.22	3.0MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.22	5.1MB
RDF (Turtle)	2013.4.22	17.7MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_ATTED_Stem_mean			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.22	2.3MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.22	3.6MB
RDF (Turtle)	2013.4.22	9.4MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_ATTED_Whole_Plant_mean			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.22	2.3MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.22	3.5MB
RDF (Turtle)	2013.4.22	9.4MB
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このデータセットをWebで検索

投稿者メッセージ送信	Koro_Nishikata
共同編集者	Robert Cox
関連するWebサイト	http://atted.jp/ http://arabidopsis.org/servlets/TairOb...
データのリファレンス	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/171... http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/158...
合計ダウンロード数	591
最初に登録した日	Apr 22, 2013
最後に更新した日	Apr 25, 2013

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